武昌起义胜利后，1912年蔡元培担任教育总长，他最终提出了“五育”并举的新教育方针，彻底地废除了封建的教育制度，奠定了资产阶级新教育制度，“五育”就是现在上海中小学所提倡的德、智、体、美、劳。

1912年7月，蔡元培因不愿与袁世凯政府合作而辞职，再次赴法国从事学术研究。1916年，北京政府明令恢复《临时约法》，孙中山、黄兴等革命党人纷纷回国。这年11月8日，蔡元培与吴玉章一起乘船由马赛回到上海。同年12月26日，49岁的蔡元培受命担任北京大学校长。

葛剑雄说，我们看到蔡元培的行动，从政治上，他希望通过清朝政府，来进行变革，到后来励志推翻清朝政府，到采取一些激进的手段，到同时通过教育来救国，蔡元培对真理的追求孜孜不倦。

蔡建国告诉记者：“蔡元培当时的思想以及他的行动，就说明了一点。为了振兴中华，他从具有国际化意识，新型人才的角度找手，培养年轻人投身于反清革命斗争中，这个意识一直很清晰。”

在蔡元培故居，游人络绎不绝。人们纷纷留言，留言者很多是港澳台和外籍人士。

台湾清华大学暑期研究团来沪参观，同时也来到了蔡元培故居。

超过8万人的签名似乎无声地阐述着这样一个事实：社会对于一位终身忠于国家和文化而不及其私的公民是不会忘记的。